Już na początku lat '90 rozpoczęła się współpraca Senatu z organizacjami pozarządowymi. Pracownicy Kancelarii Senatu uczestniczyli w szkoleniach takich jak np.:
- "Niemcy po zjednoczeniu" - Fundacja Batorego -czerwiec 1994,
- "Polsko-niemiecko-amerykańskie seminarium konstytucyjne" zorganizowane w Sejmie przez Fundację Naumanna - październik 1995,
- "Współpraca Rządu, Administracji Lokalnej z Sektorem Organizacji Pozarządowych" - Forum Fundacji Polskich - październik 1995,
oraz wielu innych. Z czasem rozpoczęto szerszą współpracę polegającą na czynnym uczestnictwie w różnych spotkaniach, aż po współorganizację i organizację seminariów i konferencji.
W 1995 r. Biuro Studiów i Analiz Kancelarii Senatu współorganizowało "Spotkanie z przedstawicielami organizacji pozarządowych", które odbyło się 18 lutego 1995 r. w gmachu Sejmu z inicjatywy Parlamentarnej Grupy Kobiet oraz Pełnomocnika Rządu ds. Kobiet i Rodziny.
12 czerwca 1995 r. z inicjatywy Senatu RP w sali plenarnej odbyło się seminarium "Budowa Społeczeństwa Obywatelskiego - rola organizacji pozarządowych w Polsce". Uczestnicy seminarium postawili wniosek o objęcie patronatem i opieką organizacji pozarządowych przez Senat RP. Rolą Senatu miało być tworzenie życzliwej atmosfery wokół organizacji pozarządowych, przełamanie podziału: państwo - my, a także wypracowanie partnerskiej współpracy między Rządem a organizacjami pozarządowymi. W BID dostępny jest stenogram nr S-14.
Od 1993 r. w Senacie interesowano się problematyką lobbyingu. Zaowocowało to zorganizowaniem przez Senat w dniu 7 listopada 1995 r. seminarium "Sens, istota i granice lobbyingu". Efektem tego seminarium było powołanie pod przewodnictwem senatora Sylwestra Gajewskiego, Zespołu ds. Lobbyingu przy Biurze Studiów i Analiz. Członkami tej grupy byli parlamentarzyści, pracownicy Kancelarii Senatu, eksperci, przedstawiciele organizacji gospodarczych, prywatnych firm lobbingowych, a także Projektu GEMINI-PEDS (Projekt Wspierania Rozwoju Prywatnej Przedsiębiorczości). Wynikiem prac zespołu pracującego pod kierownictwem Jacka Michałowskiego, ówczesnego dyrektora Biura Studiów i Analiz, była publikacja Udział organizacji społecznych i gospodarczych w procesie legislacyjnym w Polsce. Analiza i Propozycje, wydana we wrześniu 1996 r. przez GEMINI-PEDS Project. Wyniki swojej pracy Zespół ds. Lobbyingu przedstawił na zorganizowanej przez siebie i przez GEMINI-PEDS Project konferencji "Udział organizacji społecznych i gospodarczych w procesie legislacyjnym", która odbyła się w dniu 21 stycznia 1997 r. w Hotelu Sheraton. W BID dostępny jest stenogram nr S-22.
W dniach 5 i 6 kwietnia 2002 r. pod patronatem marszałka Longina Pastusiaka, odbyła się w Senacie konferencja "Rola organizacji pozarządowych w społeczeństwie obywatelskim" zorganizowana przez Parlamentarną Grupę Kobiet i Fundację im. Friedricha Eberta (sprawozdanie z konferencji na stronie internetowej Senatu).
Senat organizował także seminaria tematyczne przy współudziale organizacji pozarządowych:
- Przeciw wykluczeniu - konferencja - 13.01.2003 - Grupa Parlamentarna na Rzecz Osób z Autyzmem oraz Fundacja Synapsis
- Zapobieganie i zwalczanie przestępczości w Polsce przy zastosowaniu probacyjnych środków karania - konferencja - 01-02.12.2003 Popowo - Komisja Ustawodawstwa i Praworządności wspólnie z Rzecznikiem Praw Obywatelskich, ministrem sprawiedliwości, Centralnym Zarządem Służby Więziennej oraz Stowarzyszeniem Pomocy Społecznej, Rehabilitacji i Resocjalizacji im. H.Ch. Kofoeda w Siedlcach
Senat współpracował także z organizacjami pozarządowymi w zakresie organizacji wystaw na terenie Kancelarii Senatu (np. cykliczne wystawy prac dzieci niepełnosprawnych).
